说好的一起binning,你却偷偷改了名

之前尝试处理宏基因组测序数据，使用metawrap开始binning的时候遇到了下面这个报错：mapping生成sam文件时出现[mem_sam_pe]pairedreadshavedifferentnames错误

就是序列文件中，名字本来应该对应的，结果对应不上

可能是使用KneadData进行质量控制和去宿主的时候带来的问题

上面这个说法只是一个假设，要验证的话可以将原始数据用metawrap包装的质控和去宿主软件跑一遍，看看会不会出现同样的报错

当时遇到这个问题后，寻找了很久，发现了重命名的这个方法，如下：

condainstall-cbiocondabbmap##用以下命令修复：bbrename.shin1=read1.fqin2=read2.fqout1=renamed1.fqout2=renamed2.fq##对于多个fq文件，可以用以下命令：whilereadlinedonohupbbrename.shin={line}_R1.fqin2={line}_R2.fqout={line}_R1.sh.fqout2={line22}_R2.sh.fqdonename.txt#####其中，name.txt指的是包含sample名字文件

实测是可以解决报错的，但是zhang胸提出：这种强制给序列重新命名的方法，会不会造成分析结果不准（或者说结果不符合实际）

仍有待考证，但是如果使用metawrap自带的质控软件可以避免这个报错，那是再好不过了。